RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	32.07	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	KBTBD13	C9JR72	458 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	PGK2	P07205	417 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	BMP3	P12645	472 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	BMP8B	P34820	402 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		32.06	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	OAZ1	P54368	228 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	ALX1	Q15699	326 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	CPXCR1	Q8N123	301 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	GDF15	Q99988	308 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	TINF2	Q9BSI4	451 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	SYN1	P17600	705 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	STAT2	P52630	851 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	VPS53	Q5VIR6	699 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	DDX11	Q96FC9	970 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	GMCL1	Q96IK5	515 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	FBXO40	Q9UH90	709 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	STX8	Q9UNK0	236 aa		32.04	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM160B2	Q86V87	743 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM227B	Q96M60	508 aa		32.03	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	ZMYM6	O95789	1325 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A0D9SFI3	127 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC1A4	P43007	532 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	RILPL2	Q969X0	211 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		32.02	■■■□□ 2.72
LYNX1-208	ENST00000615007	ORC4	O43929	436 aa		32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC4A3	P48751	1232 aa		32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	ANO1	Q5XXA6	986 aa		32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	CHST13	Q8NET6	341 aa		32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM232	C9JQI7	657 aa		32	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RARB	P10826	455 aa		32	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RIPK3	Q9Y572	518 aa		32	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	NUCB1	Q02818	461 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	TOMM22	Q9NS69	142 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		31.99	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	PLA2G6	O60733	806 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	FGA	P02671	866 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	FGR	P09769	529 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	AKR1A1	P14550	325 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		31.98	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		31.97	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		31.97	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	MCC	P23508	829 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC41	Q15345	812 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	INCENP	Q9NQS7	918 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		31.96	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	IGHD	P01880	384 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RTP1	P59025	263 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	RNF180	Q86T96	592 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		31.95	■■■□□ 2.71
LYNX1-208	ENST00000615007	NMT2	O60551	498 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	NOV	P48745	357 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	TKFC	Q3LXA3	575 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	ACAD9	Q9H845	621 aa		31.94	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	SDS	P20132	328 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	TDH	Q8IZJ6	230 aa		31.93	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	HIP1	O00291	1037 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	KCTD1	Q719H9	257 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	DCAF4	Q8WV16	495 aa		31.92	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
LYNX1-208	ENST00000615007	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		31.92	■■■□□ 2.7

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