RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592364.5

ATP5A1-218, Transcript of ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

TSL 5

Gene ATP5A1, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1-218ENST00000592364 MMP19Q99542 508 aa14.73□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 KCTD2Q14681 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 VWCEQ96DN2 955 aa14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.72□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 ATRXP46100 2492 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 EYA2O00167 538 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 NBPF20Q3BBV1 942 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 TRPV6Q9H1D0 765 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.71□□□□□ -0.05
ATP5A1-218ENST00000592364 SLC25A27O95847 323 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 GJA9P57773 515 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ITGA7Q13683 1181 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ADSSL1Q8N142 457 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SLC43A3Q8NBI5 491 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ACER1Q8TDN7 264 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.7□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 KDM4AO75164 1064 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CABYRO75952 493 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 HLA-DOAP06340 250 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 AVPR2P30518 371 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 RASGRF1Q13972 1273 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.69□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 COL4A6Q14031 1691 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 TRIOO75962 3097 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 LCHNA4D1U4 455 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 APAF1O14727 1248 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 B4GALT4O60513 344 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 NBL1P41271 181 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 KCNJ6P48051 423 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ERVK-21P61565 698 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CCDC102BQ68D86 513 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ZNF384Q8TF68 577 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SIL1Q9H173 461 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PALD1Q9ULE6 856 aa14.68□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ZBTB22O15209 634 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 RFC2P35250 354 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 NUBP1P53384 320 aa14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ACACBO00763 2458 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 DSG3P32926 999 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ZXDAP98168 799 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 BEX3Q00994 111 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PTPROQ16827 1216 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CRBNQ96SW2 442 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CABP5Q9NP86 173 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 RAI14Q9P0K7 980 aa14.66□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 BAG3O95817 575 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PLCG2P16885 1265 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ACVR2BQ13705 512 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 RMDN1Q96DB5 314 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 ATG4CQ96DT6 458 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 CLDND1Q9NY35 253 aa14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ATP5A1-218ENST00000592364 PLXNA3P51805 1871 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP5A1-218ENST00000592364 STXBP3O00186 592 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP5A1-218ENST00000592364 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ATP5A1-218ENST00000592364 FLOT1O75955 427 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP5A1-218ENST00000592364 BAIAP3O94812 1187 aa14.64□□□□□ -0.07
ATP5A1-218ENST00000592364 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms