RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 NAPBQ9H115 298 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 H0YHG0 523 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 MICALL2Q8IY33 904 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 CEP112Q8N8E3 955 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 STAG1Q8WVM7 1258 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 USP40Q9NVE5 1235 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF569Q5MCW4 686 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 STK11IPQ8N1F8 1099 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 STX10O60499 249 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ZMYND10O75800 440 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GRM1Q13255 1194 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 HOOK2Q96ED9 719 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF287Q9HBT7 754 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 NUP98P52948 1817 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 POTEB2H3BUK9 544 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 CTDNEP1O95476 244 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 NCAPH2Q6IBW4 605 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZUG5 572 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ODF2LQ9ULJ1 636 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 CLIC4Q9Y696 253 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GRIN2DO15399 1336 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 NFKBIEO00221 500 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 KLRK1P26718 216 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 POTEDQ86YR6 584 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 RIC1Q4ADV7 1423 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 AGPSO00116 658 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 IKBKBO14920 756 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 KCNA3P22001 575 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 PI16Q6UXB8 463 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 CLRN2A0PK11 232 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 ADALQ6DHV7 355 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 GPC2Q8N158 579 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 HINFPQ9BQA5 517 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 POLD4Q9HCU8 107 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPS1-211ENST00000520276 C4AP0C0L4 1744 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MYL5Q02045 173 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RDXP35241 583 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CCT2P78371 535 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35F6Q8N357 371 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 HAUS7Q99871 368 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TAF1LQ8IZX4 1826 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CBFA2T2O43439 604 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 TCP10Q12799 353 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 PTPDC1A2A3K4 754 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CHUKO15111 745 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE8P0CG41 777 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 MCAMP43121 646 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 FAM76AQ8TAV0 307 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CENPHQ9H3R5 247 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 RRAGCQ9HB90 399 aa11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TRPS1-211ENST00000520276 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.32□□□□□ -0.6
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