RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG4-208ENST00000514110 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.56□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 FOXP2O15409 715 aa14.55□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 MX1P20591 662 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SLC4A3P48751 1232 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SNX17Q15036 470 aa14.55□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.55□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 ZBED4O75132 1171 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 TTLL1O95922 423 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 NAPBQ9H115 298 aa14.54□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.54□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 FEM1BQ9UK73 627 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.53□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SNHG4-208ENST00000514110 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14.52□□□□□ -0.08
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SNHG4-208ENST00000514110 TLE2Q04725 743 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.52□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 CRBNQ96SW2 442 aa14.52□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.52□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 A0A1W2PQY0 241 aa14.51□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 TMEM232C9JQI7 657 aa14.51□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 POTEB2H3BUK9 544 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 ADCY6O43306 1168 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 NMT2O60551 498 aa14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 GMCL1Q96IK5 515 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 IL17RBQ9NRM6 502 aa14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-208ENST00000514110 MYADML2A6NDP7 307 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 MCCP23508 829 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 STAT2P52630 851 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 ACVR2BQ13705 512 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 KCTD1Q719H9 257 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-208ENST00000514110 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.49□□□□□ -0.09
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