RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TTLL1O95922 423 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 TSPY3P0CV98 308 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 TSPY8P0CW00 308 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 PDE4BQ07343 736 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 SNX17Q15036 470 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 TRIM60Q495X7 471 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 KIFC2Q96AC6 838 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 DDX11Q96FC9 970 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 NAPBQ9H115 298 aa20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HERC3-211ENST00000513325 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ATP2A1O14983 1001 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PGK1P00558 417 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 TFAP4Q01664 338 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PPARAQ07869 468 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 MYH4Q9Y623 1939 aa20.14■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 DNAH12Q6ZR08 3092 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 AKR1A1P14550 325 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SLFN13Q68D06 897 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 FEM1BQ9UK73 627 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PHF24Q9UPV7 400 aa20.13■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 RNF180Q86T96 592 aa20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 FOXP2O15409 715 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 BMP3P12645 472 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 TLE2Q04725 743 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 BADQ92934 168 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CRBNQ96SW2 442 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 INCENPQ9NQS7 918 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 LTBP2Q14767 1821 aa20.1■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQY0 241 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 TMEM232C9JQI7 657 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS4O75173 837 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 OAZ1P54368 228 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CHST13Q8NET6 341 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 FBXO40Q9UH90 709 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SHHQ15465 462 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 VPS53Q5VIR6 699 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 EVI5LQ96CN4 794 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 FGD4Q96M96 766 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 STX8Q9UNK0 236 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.08■□□□□ 0.81
HERC3-211ENST00000513325 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 TSPY2A6NKD2 308 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 NMT2O60551 498 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 FDX1P10109 184 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 MCCP23508 829 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 SLC1A4P43007 532 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 STAT2P52630 851 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 ACVR2BQ13705 512 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 GMCL1Q96IK5 515 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.07■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 POTEB2H3BUK9 544 aa20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
HERC3-211ENST00000513325 CLTBP09497 229 aa20.06■□□□□ 0.8
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