RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.81■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-210ENST00000505941 RPTORQ8N122 1335 aa24.81■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 CENPFP49454 3210 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-210ENST00000505941 KDM4AO75164 1064 aa24.8■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 GJA8P48165 433 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-210ENST00000505941 NOVP48745 357 aa24.8■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 MMP19Q99542 508 aa24.8■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 B4E1Z4 1266 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-210ENST00000505941 PLA2G6O60733 806 aa24.79■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 DEFB118Q96PH6 123 aa24.79■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 IL25Q9H293 177 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.79■■□□□ 1.56
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SH3BP2-210ENST00000505941 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-210ENST00000505941 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 PGK2P07205 417 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF543Q08ER8 600 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 SHISA4Q96DD7 197 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-210ENST00000505941 MAML3Q96JK9 1138 aa24.69■■□□□ 1.54
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