RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RARBP10826 455 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 SLFN13Q68D06 897 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 REPS2Q8NFH8 660 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 TSPY2A6NKD2 308 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 BMP3P12645 472 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 RTP1P59025 263 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 FDX1P10109 184 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 RNF180Q86T96 592 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 LRCH3Q96II8 777 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 FBXO40Q9UH90 709 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 ATP2A1O14983 1001 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 AKR1A1P14550 325 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 OAZ1P54368 228 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 AAMPQ13685 434 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 LRRC41Q15345 812 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 STX8Q9UNK0 236 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 RIPK3Q9Y572 518 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.89■■□□□ 1.42
ACTB-212ENST00000484841 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 SLC1A4P43007 532 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 STAT2P52630 851 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 PDE1AP54750 535 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 FAM160B2Q86V87 743 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 FERMT2Q96AC1 680 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TOMM22Q9NS69 142 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TMEM232C9JQI7 657 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 CHST13Q8NET6 341 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 GPR153Q6NV75 609 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 GMCL1Q96IK5 515 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 PGK1P00558 417 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 MCCP23508 829 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TRIM60Q495X7 471 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 TICAM2Q86XR7 235 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 RILPL2Q969X0 211 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 LNPKQ9C0E8 428 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 PHF24Q9UPV7 400 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 MTMR7Q9Y216 660 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ACAD9Q9H845 621 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.413e-23■■□□□ 14.2
ACTB-212ENST00000484841 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 ALX1Q15699 326 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 VPS53Q5VIR6 699 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 SPC25Q9HBM1 224 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-212ENST00000484841 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 SNX17Q15036 470 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 CCDC96Q2M329 555 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 TKFCQ3LXA3 575 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.46e-19■■□□□ 12.8
ACTB-212ENST00000484841 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 INCENPQ9NQS7 918 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 ORC4O43929 436 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 ACVR2BQ13705 512 aa23.81■■□□□ 1.4
ACTB-212ENST00000484841 KCTD1Q719H9 257 aa23.81■■□□□ 1.4
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