RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442081.6

HIVEP1-203, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene HIVEP1, Length 1,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-203ENST00000442081 SHISA4Q96DD7 197 aa23.5■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.5■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 MYH4Q9Y623 1939 aa23.5■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 TMEM232C9JQI7 657 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 MCCP23508 829 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 TRIM32Q13049 653 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 CCL14Q16627 93 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 DCAF4Q8WV16 495 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 DEFB118Q96PH6 123 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 IL25Q9H293 177 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 PARP14Q460N5 1801 aa23.49■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 KRT23Q9C075 422 aa23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.48■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 BRCA2P51587 3418 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 SGSM2O43147 1006 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 KCTD2Q14681 263 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 IQCA1Q86XH1 822 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 DGKHQ86XP1 1220 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 MMP19Q99542 508 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 NEDD4P46934 1319 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.47■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 IGHA2P01877 340 aa23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
HIVEP1-203ENST00000442081 COBLO75128 1261 aa23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 FBXO40Q9UH90 709 aa23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 KDM4AO75164 1064 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 NEFLP07196 543 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 KCTD1Q719H9 257 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CPXCR1Q8N123 301 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CHST13Q8NET6 341 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 ANKS1AQ92625 1134 aa23.44■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 B4E1Z4 1266 aa23.43■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.43■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 MSCO60682 206 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 PTH1RQ03431 593 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CCDC96Q2M329 555 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 TKFCQ3LXA3 575 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 MAML3Q96JK9 1138 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 RIPK3Q9Y572 518 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 LAMA4Q16363 1823 aa23.42■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 SNHG28P0DPA3 235 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 PDHBP11177 359 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 TRDNQ13061 729 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 MAP4K1Q92918 833 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 MTMR7Q9Y216 660 aa23.41■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CYP2C19P33261 490 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 DDX11Q96FC9 970 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 PNMA2Q9UL42 364 aa23.4■■□□□ 1.34
HIVEP1-203ENST00000442081 CYP21A2P08686 494 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 SLC4A3P48751 1232 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 LHX8Q68G74 356 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 KAT14Q9H8E8 782 aa23.39■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 ZNF536O15090 1300 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 PGK2P07205 417 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 CYBAP13498 195 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 ZNF543Q08ER8 600 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 PNMA1Q8ND90 353 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 ACAD9Q9H845 621 aa23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HIVEP1-203ENST00000442081 TNKSO95271 1327 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.6 ms