RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 SMCO2A6NFE2 343 aa26.45■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 ZMYND12Q9H0C1 365 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 COL4A5P29400 1685 aa26.45■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 TTBK2Q6IQ55 1244 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT17Q6IS24 598 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD1Q99460 953 aa26.44■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF543Q08ER8 600 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC96Q2M329 555 aa26.43■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 CCDC17Q96LX7 622 aa26.43■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A2P36021 539 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CLRN2A0PK11 232 aa26.42■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 SOGA3Q5TF21 947 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 C4orf32Q8N8J7 132 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf50Q9HD87 102 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 SARM1Q6SZW1 724 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 AFMP43652 599 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT2Q15019 361 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 PTGS1P23219 599 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CDC25AP30304 524 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM60Q9H2L4 133 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 CASP1P29466 404 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 GNA11P29992 359 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 NCAPHQ15003 741 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-209ENST00000428120 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.39■■□□□ 1.82
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FAAP20-209ENST00000428120 SMARCE1Q969G3 411 aa26.39■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 CSRNP1Q96S65 589 aa26.39■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE6P0CI01 402 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM260Q9NX78 707 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 KANK3Q6NY19 840 aa26.38■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ENTPD3O75355 529 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SLFN14P0C7P3 912 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 LETM2Q2VYF4 491 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 STAMQ92783 540 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PSME4Q14997 1843 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 USP17L10C9JJH3 530 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 JAG1P78504 1218 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
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FAAP20-209ENST00000428120 GMLQ99445 158 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ICA1Q05084 483 aa26.36■■□□□ 1.81
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FAAP20-209ENST00000428120 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.36■■□□□ 1.81
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FAAP20-209ENST00000428120 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 OGFOD1Q8N543 542 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PAGE5Q96GU1 130 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 SARSP49591 514 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 DLGAP5Q15398 846 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 NT5DC1Q5TFE4 455 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 PIM2Q9P1W9 311 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC144BQ3MJ40 725 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-209ENST00000428120 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.35■■□□□ 1.81
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