RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 TMEM139Q8IV31 216 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 A0A087X0B3 334 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 NPY5RQ15761 445 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 EPSTI1Q96J88 318 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 NMT2O60551 498 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 RFC4P35249 363 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TNFRSF25Q93038 417 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 CEP89Q96ST8 783 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 CPP00450 1065 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SATB1Q01826 763 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 DHX58Q96C10 678 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 WDR24Q96S15 920 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 DACH1Q9UI36 760 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TUBB4AP04350 444 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 AFMP43652 599 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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HPS6-201ENST00000299238 CCDC189A1A4V9 331 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 MED4Q9NPJ6 270 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 MNAT1P51948 309 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SBK1Q52WX2 424 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 EGFL6Q8IUX8 553 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 CCP110O43303 1012 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 GRAPQ13588 217 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 PLCD1P51178 756 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 NFIXQ14938 502 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS6-201ENST00000299238 STX17P56962 302 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 STAMQ92783 540 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CNBD1Q8NA66 436 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 TSPY2A6NKD2 308 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP6O43182 974 aa22.68■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 TC2NQ8N9U0 490 aa22.68■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CCDC151A5D8V7 595 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 BMP15O95972 392 aa22.68■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 PAGE5Q96GU1 130 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.68■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.67■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.66■■□□□ 1.22
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HPS6-201ENST00000299238 NR1I3Q14994 352 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 TTC38Q5R3I4 469 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 DPYDQ12882 1025 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS6-201ENST00000299238 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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