RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhl10Q9D5V2 608 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Herc3A6H6S0 1050 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akr1c19G3X9Y6 323 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp4cP97470 307 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nsrp1Q5NCR9 542 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tpm4Q6IRU2 248 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tango6Q8C3S2 1079 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc38Q8CDN8 563 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Afg3l2Q8JZQ2 802 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt82Q99M74 516 aa29.52■■■□□ 2.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif23E9Q5G3 953 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eya3P97480 510 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igbp1Q61249 340 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmx1Q8VBT0 278 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nr1i2O54915 431 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk8Q8R3L8 464 aa29.51■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tpp1O89023 562 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 DnttP09838 530 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nap1l2P51860 460 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Irx2P81066 474 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Uap1Q91YN5 522 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lonp2Q9DBN5 852 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prpf40bQ80W14 870 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem63cQ8CBX0 802 aa29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trub2Q91WG3 331 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chp1P61022 195 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt86P97861 486 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PRAG1Q571I4 1179 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 OplahQ8K010 1288 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hps4Q99KG7 671 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Jag1Q9QXX0 1218 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa29.49■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ddx23D3Z0M9 819 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mboat4P0C7A3 435 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtss1lQ6P9S0 715 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phldb2Q8K1N2 1249 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmpd4A2AFR3 1320 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chd5A2A8L1 1946 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Golgb1E9PVZ8 3238 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MicalclQ9D5U9 680 aa29.48■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scgb2b19J3QM75 112 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgef2Q60875 985 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 UvssaQ9D479 717 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam217aQ9D9W6 419 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp1a4Q9WV27 1032 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcd1P48410 736 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccdc14Q8K2J4 934 aa29.47■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gcom1E9PZ54 550 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MyzapQ3UIJ9 466 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc51aQ8R000 340 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp2r5dQ91V89 594 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snrnp35Q9D384 244 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prl2c5Q9JLV9 222 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif2aP28740 705 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hgh1Q8C3I8 393 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spice1Q8C804 860 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PdclQ9DBX2 301 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ltbp1Q8CG19 1712 aa29.46■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arhgap33Q80YF9 1305 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ltbp2O08999 1813 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cabp7Q91ZM8 215 aa29.45■■■□□ 2.31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnb1Q03717 857 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccna1Q61456 421 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hs2st1Q8R3H7 356 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnajc14Q921R4 703 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MymkQ9D1N4 221 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trmt44Q9D2Q2 713 aa29.45■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm5934D3Z4U6 212 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankrd13aQ80UP5 588 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem134Q8R0J4 195 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ctdp1Q7TSG2 960 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epn1Q80VP1 575 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc23Q8BGZ4 597 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 EhhadhQ9DBM2 718 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arl6ip4Q9JM93 229 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa29.44■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7356A0A087WSA6 508 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan18E9PUD6 809 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phrf1A6H619 1682 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Git2Q9JLQ2 708 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa29.43■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lzts2Q91YU6 671 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trmt112Q9DCG9 125 aa29.42■■■□□ 2.3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cnbd1B1AWM0 430 aa29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms