RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	RAD30	Q04049	632 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	AFT2	Q08957	416 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	CLB2	P24869	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YTP1	P53584	459 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	CAC2	Q04199	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	INP53	Q12271	1107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	HER1	Q12276	1246 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YPR089W	O13585	888 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ASK1	P35734	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PCI8	P40512	444 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SNM1	P40993	198 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PSR1	Q07800	427 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	GEP3	Q08622	556 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	RGT2	Q12300	763 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	KAR3	P17119	729 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SAN1	P22470	610 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SCO2	P38072	301 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	UIP3	P39547	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ZDS2	P54786	942 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	ATX2	Q12067	313 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATG34	YOL083W	SEM1	O94742	89 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	AAC3	P18238	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	PRE8	P23639	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MNN2	P38069	597 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	SPC97	P38863	823 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	RTS1	P38903	757 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	VPS25	P47142	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	GLO1	P50107	326 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	NNF2	P53253	936 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MAK10	Q02197	733 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MAL33	P38157	468 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	LEU5	P38702	357 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	BUR6	P40096	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	TMA108	P40462	946 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	GAT1	P43574	510 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	GSH2	Q08220	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	TCO89	Q08921	799 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YCK1	P23291	538 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MGM1	P32266	881 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	TMT1	P32643	299 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YKL050C	P35736	922 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MIA40	P36046	403 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YIR016W	P40572	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MDV1	P47025	714 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	SMC3	P47037	1230 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	DIA3	P52290	468 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	SGF73	P53165	657 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	NGL3	Q03210	505 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	POS5	Q06892	414 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	RTT109	Q07794	436 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	CIR2	Q08822	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ENT1	Q12518	454 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	EDE1	P34216	1381 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	VMA16	P23968	213 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	AGP2	P38090	596 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ARP1	P38696	384 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	HXT9	P40885	567 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	IZH1	Q03419	316 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	YML037C	Q03703	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ARP9	Q05123	467 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	MCP2	Q06567	569 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
ATG34	YOL083W	RRI2	Q12348	645 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ICT1	Q12385	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ATG34	YOL083W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76

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