RNA–Protein interactions for RNA: YMR204C

INP1, Transcript of Peripheral membrane protein of peroxisomes, yeast

Gene INP1, Length 1,263 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
INP1	YMR204C	SAN1	P22470	610 aa		3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	EXO84	P38261	753 aa		3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	AZF1	P41696	914 aa		3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	VAM6	Q07468	1049 aa		3.44	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	MSS18	P08593	268 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	SPO16	P17122	198 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	BUD14	P27637	709 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	RPN12	P32496	274 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YHR218W	P38899	603 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	SPC72	P39723	622 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	FET5	P43561	622 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	CTK2	P46962	323 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	MET14	Q02196	202 aa		3.43	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	GID7	P25569	745 aa		3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	BLI1	P35727	113 aa		3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	FUI1	P38196	639 aa		3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	HIS6	P40545	261 aa		3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	TRS130	Q03660	1102 aa		3.42	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	GAL1	P04385	528 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	REV1	P12689	985 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	CLB2	P24869	491 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YBR138C	P38277	524 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	ERR3	P42222	437 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YTP1	P53584	459 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	MAK10	Q02197	733 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	CRN1	Q06440	651 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	YDL218W	Q07629	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	TLG2	Q08144	397 aa		3.41	□□□□□ -1.86
INP1	YMR204C	CBS2	P14905	389 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	PTP2	P29461	750 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NUP120	P35729	1037 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MIC60	P36112	540 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YJL068C	P40363	299 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ATG16	Q03818	150 aa		3.4	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ERG7	P38604	731 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MDM31	P38880	579 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	RTS1	P38903	757 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	PUG1	P40100	303 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	RGI2	P40188	164 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	HIM1	Q06674	414 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NYV1	Q12255	253 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ERP4	Q12450	207 aa		3.39	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	CLB4	P24871	460 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	AVT5	P38176	459 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NPR3	P38742	1146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ECM10	P39987	644 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YGR021W	P53212	290 aa		3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ATP4	P05626	244 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	RSM28	Q03430	361 aa		3.37	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	TFC3	P34111	1160 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	JNM1	P36224	373 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	SWP82	P43554	623 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	ASE1	P50275	885 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NUP100	Q02629	959 aa		3.36	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MRS3	P10566	314 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	OPI1	P21957	404 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YIL060W	P40519	144 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	GUF1	P46943	645 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	SHE10	P53075	577 aa		3.35	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	GAC1	P28006	793 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	SRB5	P32585	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YHL041W	P38730	149 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	PHO90	P39535	881 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	YFR020W	P43600	232 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	BOR1	P53838	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MDM1	Q01846	1127 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	MEH1	Q02205	184 aa		3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
INP1	YMR204C	INH1	P01097	85 aa		3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	NFU1	P32860	256 aa		3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	PTH2	P34222	208 aa		3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	MRPL36	P36531	177 aa		3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	FAA2	P39518	744 aa		3.33	□□□□□ -1.88
INP1	YMR204C	VID27	P40157	782 aa		3.33	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 28.4 ms