RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SIP4	P46954	829 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MTC3	P53077	123 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	TCO89	Q08921	799 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	AHC1	Q12433	566 aa		5.36	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	COQ4	O13525	335 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YLR302C	O13544	120 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	STE12	P13574	688 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	HXT4	P32467	576 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MEI5	P32489	222 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SAP190	P36123	1033 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MSG5	P38590	489 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GIC1	P38785	314 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PTC7	P38797	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	WSS1	P38838	269 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MET18	P40469	1032 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	VID28	P40547	921 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GTS1	P40956	396 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SHR5	P41912	237 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	IRC5	P43610	853 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ORC4	P54791	529 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SMA1	Q02651	245 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SRT1	Q03175	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MMR1	Q06324	491 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YPL277C	Q08989	487 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RIM20	Q12033	661 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YLL058W	Q12198	575 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RBD2	Q12270	262 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CTF3	Q12748	733 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	DIF1	O13577	133 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CDC42	P19073	191 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	DGR2	P32330	852 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.34	□□□□□ -1.55	not detected
YMD8	YML038C	PHO11	P35842	467 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SRO77	P38163	1010 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	MMS4	P38257	691 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PHO12	P38693	467 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YIR014W	P40570	242 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	CEP3	P40969	608 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	HXT16	P47185	567 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	ALT2	P52892	507 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	YLR413W	Q06689	675 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	NMD4	Q12129	218 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	AFI1	Q99222	893 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YMD8	YML038C	PMD1	P32634	1753 aa		5.34	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YLR464W	P0CX17	216 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	SRB4	P32569	687 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	GLG1	P36143	616 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YSW1	P38280	609 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	REV7	P38927	245 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	SHC1	P39000	512 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YEL076C	P39971	216 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YKE2	P52553	114 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	NGL3	Q03210	505 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	ENT4	Q07872	247 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	OSW2	Q12202	724 aa		5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YLR278C	Q05854	1341 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YCK1	P23291	538 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	RIT1	P23796	513 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	BOS1	P25385	244 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	COT1	P32798	439 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	MSN4	P33749	630 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YKR051W	P36142	418 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	REG2	P38232	338 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	YIL077C	P40508	320 aa		5.32	□□□□□ -1.56
YMD8	YML038C	CHS6	P40955	746 aa		5.32	□□□□□ -1.56

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