RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	GCV1	P48015	400 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	REG1	Q00816	1014 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RSC4	Q02206	625 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YMR160W	Q03823	816 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	GPM3	Q12326	303 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	OCA6	Q12454	224 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CLC1	P17891	233 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RBK1	P25332	333 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.81	□□□□□ -1.48	not detected
SYF2	YGR129W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NIP100	P33420	868 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	LRG1	P35688	1017 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RIM11	P38615	370 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RPH1	P39956	796 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SSU1	P41930	458 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	TCB2	P48231	1178 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YGL108C	P53139	140 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HSP42	Q12329	375 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	PRI2	P20457	528 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SIN4	P32259	974 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NTH1	P32356	751 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	AIM26	P32858	118 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	IML3	P38265	245 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ERP2	P39704	215 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YFR018C	P43599	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	RRT5	P43607	289 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CDC55	Q00362	526 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	EMI1	Q04406	187 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YDR222W	Q04925	415 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CDA1	Q06702	301 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	PGC1	Q08959	321 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	STT4	P37297	1900 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	EPT1	P22140	391 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HOG1	P32485	435 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SQT1	P35184	431 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YET1	P35723	206 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YBR259W	P38338	688 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	BIT2	P38346	545 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	MTG2	P38860	518 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	STN1	P38960	494 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	TMN3	P40071	706 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YNL092W	P53934	400 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	PEX25	Q02969	394 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YPR078C	Q06813	372 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	FMP45	Q07651	309 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SEY1	Q99287	776 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	COX5A	P00424	153 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HOP1	P20050	605 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	EMC3	P36039	253 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	GMH1	P36125	273 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CTP1	P38152	299 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YHL008C	P38750	627 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CYC2	P38909	366 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ATM1	P40416	690 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	HLJ1	P48353	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ASK10	P48361	1146 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	MSH6	Q03834	1242 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	BSC2	Q05611	235 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	YLR030W	Q07967	263 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	IZH4	Q99393	312 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SYF2	YGR129W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	SEC62	P21825	274 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PLC1	P32383	869 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PHO11	P35842	467 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MRPL37	P36532	105 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	PHO12	P38693	467 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
SYF2	YGR129W	ELO3	P40319	345 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	LRO1	P40345	661 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TAD1	P53065	400 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	YGR127W	P53275	312 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	TIM13	P53299	105 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ARP4	P80428	489 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SYF2	YGR129W	CIA1	Q05583	330 aa		5.77	□□□□□ -1.49

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