RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSD1	YGL196W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	KIN3	P22209	435 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	DBF4	P32325	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	CST26	P38226	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	MUP3	P38734	546 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	SMF1	P38925	575 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	PKP1	P40530	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	VID30	P53076	958 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	RIM20	Q12033	661 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	PTC6	P25646	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	SRO77	P38163	1010 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ECM10	P39987	644 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	CTK2	P46962	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	BOP3	P53958	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	VPS9	P54787	451 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	AVL9	Q12500	764 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	SWI3	P32591	825 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	OAR1	P35731	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	BUR6	P40096	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	SMC3	P47037	1230 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	EFM6	P53970	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ZDS2	P54786	942 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	VPS38	Q05919	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	BUD7	Q08754	746 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSD1	YGL196W	RPN13	O13563	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YJL068C	P40363	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	FAR3	P46671	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	DIA3	P52290	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	FIN1	Q03898	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	INP53	Q12271	1107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	CLB3	P24870	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ADK2	P26364	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SYN8	P31377	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MRE11	P32829	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	RPC34	P32910	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	EXO1	P39875	702 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MRK1	P50873	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	LCL3	P53153	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	TWF1	P53250	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	RAD34	Q06665	692 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ATG29	Q12092	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ATG9	Q12142	997 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	STE12	P13574	688 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MOH1	P38191	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	IRC8	P47046	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YGR127W	P53275	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MAK10	Q02197	733 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	RMT2	Q03305	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	CYK3	Q07533	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ULA1	Q12059	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ISA2	Q12425	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	CLC1	P17891	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SPE2	P21182	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	OPI1	P21957	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PRD1	P25375	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	AAD3	P25612	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	GPI10	P30777	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	GSH1	P32477	678 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SEC66	P33754	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YBR144C	P34215	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SEF1	P34228	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	CMC1	P36064	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	TMN2	Q04562	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	SEC39	Q12745	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PET111	P08468	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PMS1	P14242	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DSD1	YGL196W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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