RNA–Protein interactions for RNA: YGL011C

SCL1, Transcript of Alpha 1 subunit of the 20S proteasome, yeast

Gene SCL1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCL1	YGL011C	IMP2'	P32351	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	MNN2	P38069	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PKP1	P40530	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YTP1	P53584	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YML122C	Q03207	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	NGL3	Q03210	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	COG4	Q06096	861 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	TCO89	Q08921	799 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YBL029W	P38201	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	FLO5	P38894	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	BUR6	P40096	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	CFD1	P40558	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	ASI1	P54074	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	STP1	Q00947	519 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	CIR2	Q08822	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	HUA2	Q12134	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	INP53	Q12271	1107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	PTP1	P25044	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	POL4	P25615	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	NET1	P47035	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	LCL3	P53153	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	NNF2	P53253	936 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YNL144C	P53907	740 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	MET8	P15807	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YPT53	P36019	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	ERP2	P39704	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YPT11	P48559	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	UBP8	P50102	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	DSD1	P53095	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YML037C	Q03703	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SWF1	Q04629	336 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	MED1	Q12321	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SPE4	Q12455	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	VMA16	P23968	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	CLB2	P24869	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SGF29	P25554	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	RPN12	P32496	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	UIP3	P39547	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	DIA3	P52290	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	TIM10	P87108	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	AGP2	P38090	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	VTC3	Q02725	835 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SCL1	YGL011C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	FLC2	P39719	783 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	MRX6	P48564	524 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ZDS2	P54786	942 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	MAK10	Q02197	733 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	CAC2	Q04199	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	RTT109	Q07794	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	SDH5	Q08230	162 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YKL050C	P35736	922 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	SCO2	P38072	301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ELO1	P39540	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	NDE1	P40215	560 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	GAT1	P43574	510 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	SMC3	P47037	1230 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	VPS25	P47142	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	SGF73	P53165	657 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ARP9	Q05123	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	NMD4	Q12129	218 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	HER1	Q12276	1246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ADH7	P25377	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	PGS1	P25578	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YIH1	P25637	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	YBR225W	P38321	900 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SCL1	YGL011C	ARP1	P38696	384 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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