RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	FMP30	Q02883	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	INA17	Q02888	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VPS36	Q06696	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RAD50	P12753	1312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SWI5	P08153	709 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CMK2	P22517	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YCR061W	P25639	631 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	AFG1	P32317	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GEX2	P36173	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ECM1	P39715	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PCI8	P40512	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ELP2	P42935	788 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PET130	P47065	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	IBA57	P47158	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PPT1	P53043	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YGL185C	P53100	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SLI1	P53304	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YPD1	Q07688	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	INP53	Q12271	1107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	COB	P00163	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PHO5	P00635	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ALG1	P16661	449 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PEP3	P27801	918 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SIP1	P32578	815 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YME2	P32843	850 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CYM1	P32898	989 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PMT1	P33775	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MAL32	P38158	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	AFG3	P39925	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YGR111W	P53265	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MAL12	P53341	584 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RMI1	Q02685	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	THI3	Q07471	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	XYL2	Q07993	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	DDC1	Q08949	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RCN2	Q12044	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PCK1	P10963	549 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
HPC2	YBR215W	AMS1	P22855	1083 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YCK1	P23291	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NFS1	P25374	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YCL068C	P25593	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	KIP1	P28742	1111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ATP7	P30902	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SPO23	P33757	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	THI2	P38141	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BSD2	P38356	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	FRT2	P39734	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YJR056C	P47115	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GTO1	P48239	356 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MND1	P53102	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RRN9	P53437	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YNL181W	P53878	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	NDE2	Q07500	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	UAF30	Q08747	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RAD9	P14737	1309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RAM1	P22007	431 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VMA3	P25515	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ADE1	P27616	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MDL2	P33311	773 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SEF1	P34228	1148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YKL107W	P34251	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	OSH7	P38755	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	FHL1	P39521	936 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VAC7	P53950	1165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BNA7	Q04066	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PPM1	Q04081	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms