RNA–Protein interactions for RNA: YBR163W

EXO5, Transcript of Mitochondrial 5'-3' exonuclease and sliding exonuclease, yeast

Gene EXO5, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO5	YBR163W	STP4	Q07351	490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	STE12	P13574	688 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CDC42	P19073	191 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	DAL2	P25335	343 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ADK2	P26364	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SWI3	P32591	825 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	GCS1	P35197	352 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ELF1	P36053	145 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	HEL1	P36113	551 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PCH2	P38126	564 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SLX1	P38324	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	VFA1	P40080	203 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YFL040W	P43562	540 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	HFD1	Q04458	532 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YLR287C	Q05881	355 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	NDJ1	Q12366	352 aa		3.57	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	OAF3	P36023	863 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	EFM2	P38347	419 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MUP3	P38734	546 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FTR1	P40088	404 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FMP10	P40098	244 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ALT2	P52892	507 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SHE10	P53075	577 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PPM1	Q04081	328 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RKI1	Q12189	258 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	AHC1	Q12433	566 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CTF3	Q12748	733 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	GYP6	P32806	458 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CSG2	P35206	410 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	JNM1	P36224	373 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	FAT1	P38225	669 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YHR054C	P38780	354 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	JHD1	P40034	492 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ESL1	P40456	1118 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PMT6	P42934	759 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ASG7	P46993	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CHS1	P08004	1131 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CCL1	P37366	393 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YMC2	P38087	329 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	TMN3	P40071	706 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	POL31	P46957	487 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SMC3	P47037	1230 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	COS5	P47187	383 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	TAF4	P50105	388 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	IMO32	P53219	342 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PPN1	Q04119	674 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	IZH3	Q07959	543 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SIL1	Q08199	421 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PLP2	Q12017	286 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	GIS3	Q12418	502 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		3.55	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PHO5	P00635	467 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	URK1	P27515	501 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	BUD2	P33314	1104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YEL075C	P39972	122 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MIT1	P40002	666 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	SEC9	P40357	651 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YIR016W	P40572	265 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	STP1	Q00947	519 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MUB1	Q03162	620 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	GYL1	Q04322	720 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	UFO1	Q04511	668 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.54	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	HAP2	P06774	265 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	MTF2	P10849	440 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	RAD57	P25301	460 aa		3.53	□□□□□ -1.84
EXO5	YBR163W	PRE4	P30657	266 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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