RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	HAL1	Q01766	294 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PFA5	Q03289	374 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CRD1	Q07560	283 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YDL218W	Q07629	317 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	AIM6	Q07716	390 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	IES4	Q08561	116 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RBD2	Q12270	262 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TYR1	P20049	452 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ATS1	P31386	333 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	VPS17	P32913	551 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CHK1	P38147	527 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	REE1	P40893	198 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MAD2	P40958	196 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	HST1	P53685	503 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RAP1	P11938	827 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PCT1	P13259	424 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	UTH1	P36135	365 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	POL31	P46957	487 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	SKY1	Q03656	742 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	HEM2	P05373	342 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.85	□□□□□ -2.27	not detected
YBL053W	YBL053W	CBF2	P32504	956 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PMU1	P36069	295 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	SWD3	P38123	315 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	RCK2	P38623	610 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YLF2	P38746	405 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	NPR2	P39923	615 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	STL1	P39932	569 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MRX1	P40050	688 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TMA108	P40462	946 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YGR079W	P53249	370 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	HOL1	P53389	586 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	PBA1	Q05778	276 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	YPR091C	Q06833	770 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ENT4	Q07872	247 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	TMS1	Q12116	473 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CHO1	P08456	276 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	BIK1	P11709	440 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ATP12	P22135	325 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	MIA40	P36046	403 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	SNG1	P46950	547 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	SAM50	P53969	484 aa		0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
YBL053W	YBL053W	CLN3	P13365	580 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	SNC1	P31109	117 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	PAH1	P32567	862 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	SDH3	P33421	198 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	LHS1	P36016	881 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	BUD16	P39988	312 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	AXL1	P40851	1208 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CHS6	P40955	746 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	OSW7	P43611	510 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CTK2	P46962	323 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	BSC5	P53755	489 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	YNL034W	P53963	612 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	RBA50	Q04418	439 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	FMP45	Q07651	309 aa		0.83	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CCH1	P50077	2039 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	SEC62	P21825	274 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ECM11	Q04110	302 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	THI20	Q08224	551 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	YPR027C	Q12079	277 aa		0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	0.82	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ECM15	P35195	104 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	SOL4	P53315	255 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	MDG1	P53885	366 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	RSN1	Q03516	953 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	PSF3	Q12146	194 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	RFM1	Q12192	310 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	INP53	Q12271	1107 aa		0.81	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	PCL1	P24867	279 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ALG8	P40351	577 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CSM2	P40465	213 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	DIA1	P54005	336 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	VHS1	Q03785	461 aa		0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	URK1	P27515	501 aa		0.79	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
YBL053W	YBL053W	ARA1	P38115	344 aa		0.79	□□□□□ -2.28

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.8 ms