RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CUL4BQ13620 913 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC63Q8NA47 563 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF394Q53GI3 561 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MUM1L1Q5H9M0 696 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 NLRX1Q86UT6 975 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 STAG1Q8WVM7 1258 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA17Q96L03 361 aa6.99□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 IGSF1Q8N6C5 1336 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KRT85P78386 507 aa6.98□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 F6X3S4 739 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 IMPDH2P12268 514 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KIF5AQ12840 1032 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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