RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530238.5

BRMS1-207, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 5

Gene BRMS1, Length 1,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-207ENST00000530238 TC2NQ8N9U0 490 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 MNS1Q8NEH6 495 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 DHX58Q96C10 678 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PRDM4Q9UKN5 801 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.31■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 GPR162Q16538 588 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FILIP1LQ4L180 1135 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SBK1Q52WX2 424 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CTR9Q6PD62 1173 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PDILTQ8N807 584 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PAGE5Q96GU1 130 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 BCS1LQ9Y276 419 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 EFCAB8A8MWE9 144 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 KIF20AO95235 890 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SRGNP10124 158 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.3■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ATP2B1P20020 1258 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 KIF5BP33176 963 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 UBXN4Q92575 508 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC51Q96ER9 411 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.29■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 VWA3AA6NCI4 1184 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CALML3P27482 149 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 DPYDQ12882 1025 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CUL4BQ13620 913 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 IQUBQ8NA54 791 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PIM2Q9P1W9 311 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CASQ1P31415 396 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC178Q5BJE1 867 aa26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SPAG1Q07617 926 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SEMA3FQ13275 785 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 CDKAL1Q5VV42 579 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SLC51AQ86UW1 340 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 PPFIBP1Q86W92 1011 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 V9GYY5 206 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 ITIH6Q6UXX5 1313 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-207ENST00000530238 SCG2P13521 617 aa26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 SHISA4Q96DD7 197 aa26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 RMND1Q9NWS8 449 aa26.26■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 USP17L12C9JPN9 530 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 USP17L21D6R901 530 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 URI1O94763 535 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 CRY2Q49AN0 593 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 USP49Q70CQ1 688 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 CCDC175P0C221 793 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 EPSTI1Q96J88 318 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ATP8B1O43520 1251 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 TADA3O75528 432 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 TUBB2AQ13885 445 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 NPY5RQ15761 445 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 MED15Q96RN5 788 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 TUBB2BQ9BVA1 445 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 SLX4Q8IY92 1834 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 TXLNAP40222 546 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 NLRP5P59047 1200 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 CNGA4Q8IV77 575 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 MASTLQ96GX5 879 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 A0A087X0B3 334 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 FAM205CA6NFA0 338 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 PBX1P40424 430 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 MECOMQ03112 1051 aa26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-207ENST00000530238 PTGDRQ13258 359 aa26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms