RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPLOC4Q8TAT6 608 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROH8Q9H579 483 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLRT1Q9NZU1 646 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXC6P09630 235 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OGDHLQ9ULD0 1010 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARP14Q460N5 1801 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 F5H6K3 240 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EVI5O60447 810 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADORA2AP29274 412 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLRC3Q07444 240 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPARAQ07869 468 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPY3P0CV98 308 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPY8P0CW00 308 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF3Q9H094 633 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYH4Q9Y623 1939 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A27O95847 323 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMC5Q8IY18 1101 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP95Q96GE4 821 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VWA5AO00534 786 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFB10O96000 172 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNGA1P29973 690 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP2C19P33261 490 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTLL1O95922 423 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHDP01880 384 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCER1AP12319 257 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAT3P40763 770 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TFAP4Q01664 338 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COBLO75128 1261 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LHX8Q68G74 356 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MKL1Q969V6 931 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RILPL2Q969X0 211 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXP2O15409 715 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS53Q5VIR6 699 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHRDL2Q6WN34 429 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM227BQ96M60 508 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP19Q99542 508 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUCB1Q02818 461 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TICAM2Q86XR7 235 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0D9SFI3 127 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPY2A6NKD2 308 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSCO60682 206 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COPB2P35606 906 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD2Q14681 263 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REPS2Q8NFH8 660 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIFC2Q96AC6 838 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INCENPQ9NQS7 918 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBED4O75132 1171 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC4A3P48751 1232 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALX1Q15699 326 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLFN13Q68D06 897 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPV1Q8NER1 839 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FEM1BQ9UK73 627 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALPK3Q96L96 1907 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHA2P01877 340 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYBAP13498 195 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C7orf61Q8IZ16 206 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPXCR1Q8N123 301 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms