RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026125.2

Alyref-201, Transcript of THO complex subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Alyref, Length 3,527 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref-201ENSMUST00000026125 Foxd1Q61345 456 aa20.08■□□□□ 0.81
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sgpp1Q9JI99 430 aa20.08■□□□□ 0.81
Alyref-201ENSMUST00000026125 Wnk3Q80XP9 1757 aa20.08■□□□□ 0.81
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa20.08■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tnip1Q9WUU8 647 aa20.08■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pet2A2AHY8 747 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Casp12O08736 419 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc44a1Q6X893 653 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm10378F6XQQ1 160 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Api5O35841 504 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Stx8O88983 236 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pbx1P41778 430 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sik1Q60670 779 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Hdhd2Q3UGR5 259 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 LgsnQ8CIX8 563 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dydc1Q9D9T0 175 aa20.07■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Speer4aF8VPX6 267 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Exoc1Q8R3S6 894 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Col20a1Q923P0 1320 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Prr16A3KMN5 304 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Scgb2b19J3QM75 112 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Surf6P70279 355 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc42Q5SV66 316 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 LpxnQ99N69 386 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 CltaO08585 235 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sco1Q5SUC9 284 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zfp446Q8C9M8 523 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mroh6V9GX81 722 aa20.06■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gm5934D3Z4U6 212 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Pde8bE9Q4S1 865 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 GpiP06745 558 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Dnm2P39054 870 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Arhgef2Q60875 985 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Abtb2Q7TQI7 1024 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc186Q8C9S4 917 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ric1Q69ZJ7 1422 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cyp19a1P28649 503 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 1700013D24RikQ0P521 120 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gps2Q921N8 327 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Six6os1Q9CTN5 574 aa20.05■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Col14a1Q80X19 1797 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Madcam1Q61826 405 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nup133Q8R0G9 1155 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Apopt1Q9CQW7 192 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Shank2Q80Z38 1476 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cyp3a25O09158 503 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gjc1P28229 396 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sept1P42209 366 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 4930550L24RikQ99PA7 320 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa20.04■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gucy1a2F8VQK3 730 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rnf41Q8BH75 317 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Cd3dP04235 173 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ighmbp2P40694 993 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 PnocQ64387 187 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tmem143Q8VD26 458 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Gpr108Q91WD0 569 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Mcm5P49718 733 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Kdm7aQ3UWM4 940 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ckap2Q3V1H1 664 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tldc1Q8K0P3 455 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 EpgnQ924X1 152 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Peg12Q9WVA7 283 aa20.03■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 NeblQ0II04 452 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Q32P12 615 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ubxn1Q922Y1 297 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 F13a1Q8BH61 732 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Rassf10Q8BL43 508 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 VmacQ8BP01 174 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Ccdc122Q8BVN0 290 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Stn1Q8K2X3 378 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 EhhadhQ9DBM2 718 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 AtrnQ9WU60 1428 aa20.02■□□□□ 0.8
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam186bD3Z420 943 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Snx12O70493 165 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 IntuQ059U7 942 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Erich4Q3UNU4 136 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Esco1Q69Z69 843 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 PdhbQ9D051 359 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Fam173bQ9D1Z3 247 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Klc4Q9DBS5 619 aa20.02■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Alpk3Q924C5 1678 aa20.01■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Nfat5Q9WV30 1534 aa20.01■□□□□ 0.79
Alyref-201ENSMUST00000026125 Tcp10bE9PYJ0 438 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms