RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TAH11P47112 604 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M NNF1P47149 201 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PCL10P53124 433 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR266WP53326 701 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data2.62□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM9Q02202 377 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EGD1Q02642 157 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS31Q03337 283 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR132CQ03900 495 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SIZ1Q04195 904 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RCO1Q04779 684 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CIA1Q05583 330 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MCP2Q06567 569 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC3Q06639 885 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PLB3Q08108 686 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GLE1Q12315 538 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR262WQ12331 272 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ZRT2Q12436 422 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SKM1Q12469 655 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR149CQ99296 730 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR056W-AI2HB52 66 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ILS1P09436 1072 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MSB1P21339 1137 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RNQ1P25367 405 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EMC1P25574 760 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC6P25632 483 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR099CP25657 155 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MGT1P26188 188 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP11P32453 318 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SRB4P32569 687 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M DEF1P35732 738 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EMC3P36039 253 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ARA1P38115 344 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR182WP38870 785 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M END3P39013 349 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ACO2P39533 789 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MEF2P39677 819 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YAL037WP39728 267 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL073CP39974 107 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YFR018CP43599 363 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BIR1P47134 954 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL108CP53139 140 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SGF73P53165 657 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CWC22P53333 577 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EFM6P53970 246 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TGL2P54857 326 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M OSH6Q02201 448 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VHS1Q03785 461 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M STP3Q05937 343 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VTA1Q06263 330 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ESC2Q06340 456 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BSC6Q08280 497 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GYP1Q08484 637 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HRK1Q08732 759 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD7Q08754 746 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PFA4Q12006 378 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM41Q12032 185 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M TGL5Q12043 749 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ERR1P0CX10 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ERR2P0CX11 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PDC5P16467 563 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PET123P17558 318 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SCL1P21243 252 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS34P22543 875 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HXT1P32465 570 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HOG1P32485 435 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MEI5P32489 222 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GCD6P32501 712 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX5P35056 612 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MPE1P35728 441 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MAK5P38112 773 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MSG5P38590 489 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GND1P38720 489 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT6P39079 546 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M CAJ1P39101 391 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GIM4P40005 111 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SCC4P40090 624 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YER158CP40095 573 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M EFM4P40516 257 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M MND2P40577 368 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M GTS1P40956 396 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PXA1P41909 870 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M SSU1P41930 458 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ERR3P42222 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR030CP47101 745 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M PMT3P47190 753 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M HLJ1P48353 224 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M APT1P49435 187 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M ALF1P53904 254 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)MtW(CCA)M DIC1Q06143 298 aa2.6□□□□□ -1.99
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