RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TAH11P47112 604 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J NNF1P47149 201 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PCL10P53124 433 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR266WP53326 701 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data2.62□□□□□ -1.99not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM9Q02202 377 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EGD1Q02642 157 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS31Q03337 283 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR132CQ03900 495 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SIZ1Q04195 904 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RCO1Q04779 684 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CIA1Q05583 330 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MCP2Q06567 569 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC3Q06639 885 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PLB3Q08108 686 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GLE1Q12315 538 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR262WQ12331 272 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ZRT2Q12436 422 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SKM1Q12469 655 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR149CQ99296 730 aa2.62□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR056W-AI2HB52 66 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG20P08524 352 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ILS1P09436 1072 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MSB1P21339 1137 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RNQ1P25367 405 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EMC1P25574 760 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC6P25632 483 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR099CP25657 155 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MGT1P26188 188 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP11P32453 318 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SRB4P32569 687 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J DEF1P35732 738 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EMC3P36039 253 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ARA1P38115 344 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR182WP38870 785 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J END3P39013 349 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ACO2P39533 789 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MEF2P39677 819 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YAL037WP39728 267 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL073CP39974 107 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YFR018CP43599 363 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BIR1P47134 954 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL108CP53139 140 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SGF73P53165 657 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CWC22P53333 577 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ARE2P53629 642 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CSL4P53859 292 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM6P53970 246 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TGL2P54857 326 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J OSH6Q02201 448 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VHS1Q03785 461 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J STP3Q05937 343 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VTA1Q06263 330 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ESC2Q06340 456 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BSC6Q08280 497 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GYP1Q08484 637 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HRK1Q08732 759 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD7Q08754 746 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PFA4Q12006 378 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J AIM41Q12032 185 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J TGL5Q12043 749 aa2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ERR1P0CX10 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ERR2P0CX11 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PDC5P16467 563 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PET123P17558 318 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SCL1P21243 252 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS34P22543 875 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT1P32465 570 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HOG1P32485 435 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MEI5P32489 222 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD6P32501 712 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX5P35056 612 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MPE1P35728 441 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK5P38112 773 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MSG5P38590 489 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GND1P38720 489 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CCT6P39079 546 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J CAJ1P39101 391 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GIM4P40005 111 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SCC4P40090 624 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YER158CP40095 573 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM4P40516 257 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J MND2P40577 368 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J GTS1P40956 396 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PXA1P41909 870 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J SSU1P41930 458 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ERR3P42222 437 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR030CP47101 745 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J PMT3P47190 753 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J HLJ1P48353 224 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J APT1P49435 187 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J ALF1P53904 254 aa2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP15P53927 220 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
tW(CCA)JtW(CCA)J DIC1Q06143 298 aa2.6□□□□□ -1.99
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