RNA–Protein interactions for RNA: YMR025W

CSI1, Transcript of Subunit of the Cop9 signalosome, yeast

Gene CSI1, Length 888 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSI1	YMR025W	UBP13	P38187	747 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SGF73	P53165	657 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	EKI1	Q03764	534 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	ARP10	Q04549	284 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SAN1	P22470	610 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	CPR3	P25719	182 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	PAF1	P38351	445 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	YIR014W	P40570	242 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	ATG23	Q06671	453 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSI1	YMR025W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	MSH1	P25846	959 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	HXT9	P40885	567 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	RTS2	P40962	232 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	IAH1	P41734	238 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	STP3	Q05937	343 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	POL3	P15436	1097 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	YHR218W	P38899	603 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	SWA2	Q06677	668 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	CYB2	P00175	591 aa		4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	GLN3	P18494	730 aa		4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	FET5	P43561	622 aa		4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	TLG2	Q08144	397 aa		4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	EDE1	P34216	1381 aa		4	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	PET111	P08468	800 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	BIK1	P11709	440 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	EXO84	P38261	753 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	YJR061W	P40355	935 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	AZF1	P41696	914 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	FOL1	P53848	824 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	MAK10	Q02197	733 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	PPT2	Q12036	173 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	YOL114C	Q12322	202 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	REV1	P12689	985 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	ZAP1	P47043	880 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	IMA1	P53051	589 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CSI1	YMR025W	BUD14	P27637	709 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	STV1	P37296	890 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	YTP1	P53584	459 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	TEP1	P53916	434 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	RAP1	P11938	827 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	MRC1	P25588	1096 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	LHS1	P36016	881 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	AVT5	P38176	459 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	RTS1	P38903	757 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	SWT1	Q12104	458 aa		3.95	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	RPB8	P20436	146 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	CLB2	P24869	491 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	GID7	P25569	745 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	GEX2	P36173	615 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	APM3	P38153	483 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	ERR3	P42222	437 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	CTK2	P46962	323 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	PSR2	Q07949	397 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	CBS2	P14905	389 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	MRX1	P40050	688 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	TGL2	P54857	326 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.93	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	CRN1	Q06440	651 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	MRS3	P10566	314 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	YJL068C	P40363	299 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
CSI1	YMR025W	PIF1	P07271	859 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	ERG7	P38604	731 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	MDM31	P38880	579 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	GUF1	P46943	645 aa		3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	MIC60	P36112	540 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	YBR138C	P38277	524 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	FAA2	P39518	744 aa		3.89	□□□□□ -1.79
CSI1	YMR025W	SPC72	P39723	622 aa		3.89	□□□□□ -1.79

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