RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR047W	YKR047W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	AGP2	P38090	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	MIT1	P40002	666 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SWP82	P43554	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	WAR1	Q03631	944 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	PLM2	Q04383	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YEH1	Q07804	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	ESC8	Q08119	714 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SPE4	Q12455	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SMC6	Q12749	1114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	TPK2	P06245	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SWI3	P32591	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	ORC2	P32833	620 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YMC2	P38087	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	MUM2	P38236	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	GIP4	P39732	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	AFG3	P39925	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	UBP5	P39944	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	INA17	Q02888	182 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	PCL8	Q08966	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	ACF2	Q12168	779 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	VMA16	P23968	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YIH1	P25637	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YEL057C	P39983	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	DOT5	P40553	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YGR066C	P53242	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	SUN4	P53616	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	CPR8	P53728	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	RAD33	Q04231	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	YPT6	Q99260	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YKR047W	YKR047W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	UBP11	P36026	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	BUR6	P40096	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MET18	P40469	1032 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YML6	P51998	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YGL117W	P53133	265 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	BUD7	Q08754	746 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RIM20	Q12033	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	TAF3	Q12297	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	GRX6	Q12438	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YKR047W	YKR047W	PCT1	P13259	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	OPI1	P21957	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	KIN3	P22209	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	GPI10	P30777	616 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	LHS1	P36016	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MRX1	P40050	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MET28	P40573	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YFL015C	P43578	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CTK2	P46962	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	STB4	P50104	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	TIM44	Q01852	431 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ERO1	Q03103	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RSM28	Q03430	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SMF1	P38925	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CCT6	P39079	546 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	PHM8	P40025	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
YKR047W	YKR047W	MAF1	P41910	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RCF1	Q03713	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	HRD3	Q05787	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	ISA2	Q12425	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	CDC43	P18898	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	DMC1	P25453	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YKR047W	YKR047W	MNN2	P38069	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.2 ms