RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W THI3Q07471 609 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YAP7Q08182 245 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W IRC13Q08630 104 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ADE3P07245 946 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MAK31P23059 88 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YCR015CP25616 317 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CDC60P26637 1090 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W HXT1P32465 570 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SWI3P32591 825 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W HEL1P36113 551 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W LAS1P36146 502 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YEL025CP39991 1188 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W POL31P46957 487 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YGL138CP53122 345 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W TRS31Q03337 283 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W VTI1Q04338 217 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MRD1Q06106 887 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W FRE5Q08908 694 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SEC39Q12745 709 aa5.73□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W JIP3O13555 125 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PMA1P05030 918 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CTT1P06115 562 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PMR1P13586 950 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W VPS33P20795 691 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MGM1P32266 881 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W EFT1P32324 842 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SIP3P38717 1229 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.72□□□□□ -1.49not detected
VHS1YDR247W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W UME6P39001 836 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data5.72□□□□□ -1.49not detected
VHS1YDR247W YJL193WP39542 402 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MRX1P40050 688 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RIO2P40160 425 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W LRO1P40345 661 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W TMA108P40462 946 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YJL163CP46996 555 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MPS3P47069 682 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W BNA1P47096 177 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SAP4P53036 818 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W IMA1P53051 589 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W HOT1Q03213 719 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PRP42Q03776 544 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W URH1Q04179 340 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W VID22Q05934 901 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YPL216WQ08964 1102 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PLP2Q12017 286 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YDR056CQ12025 205 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ARG4P04076 463 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W HSC82P15108 705 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W ERG4P25340 473 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RAD16P31244 790 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W PDB1P32473 366 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W GCG1P32656 232 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W OLA1P38219 394 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W FSH1P38777 243 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RTS1P38903 757 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W FMP52P40008 231 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W VTC2P43585 828 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W ATG21Q02887 496 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W ADY4Q05955 493 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W DAS2Q12084 232 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W TRM13Q12383 476 aa5.71□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W SIR3P06701 978 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W SNF1P06782 633 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W OM45P16547 393 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W CDC10P25342 322 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RNQ1P25367 405 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W ARP2P32381 391 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W THI80P35202 319 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W PHO11P35842 467 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W IFA38P38286 347 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W PHO12P38693 467 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W SPL2P38839 148 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W THI6P41835 540 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W ARR3Q06598 404 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W SIL1Q08199 421 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W AIM39Q08223 395 aa5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W APL5Q08951 932 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W FOB1O13329 566 aa5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W THR4P16120 514 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W BET2P20133 325 aa5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W PRO3P32263 286 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W DSS4P32601 143 aa5.69□□□□□ -1.5
VHS1YDR247W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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