RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 USP49Q70CQ1 688 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 ANKRD7Q92527 254 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SBF2Q86WG5 1849 aa25.49■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 TUBB4AP04350 444 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SLFN14P0C7P3 912 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 PPP4CP60510 307 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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SPNS1-207ENST00000565975 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 PDILTQ8N807 584 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 KAT14Q9H8E8 782 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 CCP110O43303 1012 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 BAG3O95817 575 aa25.46■■□□□ 1.67
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SPNS1-207ENST00000565975 NLRP5P59047 1200 aa25.46■■□□□ 1.67
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SPNS1-207ENST00000565975 CERS3Q8IU89 383 aa25.46■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.46■■□□□ 1.67
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SPNS1-207ENST00000565975 CNBD1Q8NA66 436 aa25.45■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
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SPNS1-207ENST00000565975 TMX1Q9H3N1 280 aa25.45■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa25.45■■□□□ 1.67
SPNS1-207ENST00000565975 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.663e-12■■■■■ 43.2
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SPNS1-207ENST00000565975 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.45■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 TFAP4Q01664 338 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF174Q15697 407 aa25.44■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS1-207ENST00000565975 A0A087X0B3 334 aa25.44■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 PAGE5Q96GU1 130 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS1-207ENST00000565975 JAG2Q9Y219 1238 aa25.44■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 ZNF592Q92610 1267 aa25.43■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-207ENST00000565975 PNMA1Q8ND90 353 aa25.42■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 ATP2B4P23634 1241 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-207ENST00000565975 FAM182BQ5T319 152 aa25.4■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 MED15Q96RN5 788 aa25.4■■□□□ 1.66
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SPNS1-207ENST00000565975 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 AFMP43652 599 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 CUL4BQ13620 913 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-207ENST00000565975 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.38■■□□□ 1.65
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