RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ROBO3Q96MS0 1386 aa16.34■□□□□ 0.21
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 RTP1P59025 263 aa16.33■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.33■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDE6AP16499 860 aa16.32■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMX2Q9Y320 296 aa16.3■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KBTBD13C9JR72 458 aa16.29■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.29■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.27■□□□□ 0.2
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATG4CQ96DT6 458 aa16.27■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SH2D4AQ9H788 454 aa16.27■□□□□ 0.2
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC25A27O95847 323 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CYP2D6P10635 497 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ICA1Q05084 483 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM60Q495X7 471 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM47AQ5JRC9 791 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMCHD1A6NHR9 2005 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FLOT1O75955 427 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AKR1B1P15121 316 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C12orf60Q5U649 245 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BADQ92934 168 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa16.25■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GOLIM4O00461 696 aa16.24■□□□□ 0.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FCER1AP12319 257 aa16.24■□□□□ 0.19
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