RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.44■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SMIM22K7EJ46 135 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 PTPREP23469 700 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 LHX8Q68G74 356 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SWAP70Q9UH65 585 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 COL6A3P12111 3177 aa20.43■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.42■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.42■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 AKR1B1P15121 316 aa20.42■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 GRB14Q14449 540 aa20.42■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.861e-8■■■□□ 18.8
SKIV2L-211ENST00000485349 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1W2PPC1 479 aa20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.41■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 COL6A1P12109 1028 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SYN1P17600 705 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 ICA1Q05084 483 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 COG2Q14746 738 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXC6P09630 235 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 UBE3CQ15386 1083 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 C12orf60Q5U649 245 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 GDF15Q99988 308 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L12C9JPN9 530 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 USP17L21D6R901 530 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CYP2C19P33261 490 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CDK8P49336 464 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 TMX2Q9Y320 296 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.38■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ADORA2AP29274 412 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ATP2B2Q01814 1243 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 TRPV1Q8NER1 839 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 LPAR1Q92633 364 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 LRCH3Q96II8 777 aa20.37■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 FLOT1O75955 427 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 IGHA2P01877 340 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ERCC3P19447 782 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DSG3P32926 999 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC26Q2I0M4 334 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ATG4CQ96DT6 458 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SH2D4AQ9H788 454 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 VCPKMTQ9H867 229 aa20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CNGA1P29973 690 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 BMP8BP34820 402 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CTR9Q6PD62 1173 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 MB21D1Q8N884 522 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC17Q96LX7 622 aa20.35■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 CYBAP13498 195 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 PLS1Q14651 629 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 DPP9Q86TI2 863 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.34■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 COBLO75128 1261 aa20.33■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.33■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.33■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SKIV2L-211ENST00000485349 STRNO43815 780 aa20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MSCO60682 206 aa20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MROH8Q9H579 483 aa20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.32■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 MYH4Q9Y623 1939 aa20.31■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.31■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.31■□□□□ 0.84
SKIV2L-211ENST00000485349 LTBP2Q14767 1821 aa20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms