RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTPRN-210ENST00000460801 SPATA20Q8TB22 786 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRN-210ENST00000460801 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PTPRN-210ENST00000460801 BARHL2Q9NY43 387 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRN-210ENST00000460801 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTPRN-210ENST00000460801 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.89■□□□□ 0.13
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