RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AcrP23578 436 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klrb1bP27812 223 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Irs1P35569 1233 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hmgcs2P54869 508 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csrnp3P59055 597 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eid1Q9DCR4 169 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rlbp1Q9Z275 317 aa13.4□□□□□ -0.26
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mia3Q8BI84 1930 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plxnb3Q9QY40 1902 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc188F6WEU2 249 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Flot1O08917 428 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abl1P00520 1123 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hoxc10P31257 342 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr5a1P33242 462 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpf3P58269 378 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stim2P83093 746 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc17Q91WT4 303 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndufv1Q91YT0 464 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Add2Q9QYB8 725 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bdp1Q571C7 2467 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Astn1Q61137 1302 aa13.39□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TicrrQ8BQ33 1889 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Skint3A7TZF0 458 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gml2G5E8L7 176 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc4a4O88343 1079 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam15O88839 864 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2d10P24456 504 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mybl2P48972 704 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtpreP49446 699 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2c38P56655 490 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lpar1P61793 364 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col6a1Q04857 1025 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pls1Q3V0K9 630 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Miga1Q4QQM5 600 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Entpd3Q8BFW6 529 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ier5lQ99J55 406 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armcx1Q9CX83 456 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Appbp2Q9DAX9 585 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad50P70388 1312 aa13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rabgap1A2AWA9 1064 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CrcpO35427 148 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scnn1aQ61180 699 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ecm1Q61508 559 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EngaseQ8BX80 734 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam126bQ8C729 530 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhot2Q8JZN7 620 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dppa3Q8QZY3 150 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd54Q91WK7 299 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mcoln1Q99J21 580 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrf4Q9D2L6 698 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Efcc1Q9JJF6 558 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcar3Q9QZK2 820 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo15bI7HPW8 3033 aa13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ephb4P54761 987 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pla2g5P97391 137 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasip1Q3U0S6 961 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam170aQ66LM6 333 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BcrQ6PAJ1 1270 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb13Q8CDC0 389 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Btbd7Q8CFE5 1130 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BaatQ91X34 420 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bap1Q99PU7 728 aa13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baz2bA2AUY4 2123 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Guca2bO09051 106 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hps5P59438 1126 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb7bQ64321 544 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx11Q6AXC6 880 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc14aQ6GQT0 603 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ift74Q8BKE9 600 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Brf1Q8CFK2 676 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alas1Q8VC19 642 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FAM186AQ9D9R9 1790 aa13.35□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc146E9Q9F7 977 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prom1O54990 867 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Copb2O55029 905 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcn4O70507 1186 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp53P15975 1069 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sept4P28661 478 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptpn22P29352 802 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ProcP33587 460 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GlrbP48168 496 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf667Q2TL60 609 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem63bQ3TWI9 832 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MyrflQ3UN70 904 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prmt6Q6NZB1 378 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kiaa1328Q6NZK5 612 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms