RNA–Protein interactions for RNA: YNL205C

YNL205C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL205C, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL205C	YNL205C	RPN4	Q03465	531 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL205C	YNL205C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YNL205C	YNL205C	SWF1	Q04629	336 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL205C	YNL205C	APM4	Q99186	491 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YNL205C	YNL205C	AEP2	P22136	580 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	IDS2	P46958	469 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	NPA3	P47122	385 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YNL234W	P53857	426 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YOR378W	Q08902	515 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CTT1	P06115	562 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	ATS1	P31386	333 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YPK3	P38070	525 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YBP1	P38315	674 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	UBX6	P47049	396 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MNT2	P53059	558 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	EKI1	Q03764	534 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CRF1	Q04930	467 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RSF1	Q05043	376 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.64	□□□□□ -2.31	not detected
YNL205C	YNL205C	YOL098C	Q12496	1037 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	VPS5	Q92331	675 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	COX1	P00401	534 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SIP1	P32578	815 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RTS2	P40962	232 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	FET5	P43561	622 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	IRC5	P43610	853 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	HLJ1	P48353	224 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	ASI1	P54074	624 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	0.63	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	LAC1	P28496	418 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	DAL3	P32459	195 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	EAF5	P39995	279 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	HXT9	P40885	567 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CCH1	P50077	2039 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	POL3	P15436	1097 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	AGP2	P38090	596 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	PEA2	P40091	420 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YJL068C	P40363	299 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YJL213W	P40896	331 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MAD2	P40958	196 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	SGF73	P53165	657 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YNR071C	P53757	342 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	ATG21	Q02887	496 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MCP2	Q06567	569 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	HOS1	Q12214	470 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	EDE1	P34216	1381 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	DID4	P36108	232 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	GUF1	P46943	645 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	NNF1	P47149	201 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	COS10	P52924	374 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	TRS31	Q03337	283 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YLR455W	Q06188	304 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	STE50	P25344	346 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPH1	P39956	796 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YER130C	P39959	443 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	EMP65	P40085	556 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	RPR2	P40571	144 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	IAH1	P41734	238 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YGR079W	P53249	370 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	MAK10	Q02197	733 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	YDR109C	Q04585	715 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YNL205C	YNL205C	CHO1	P08456	276 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL205C	YNL205C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL205C	YNL205C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL205C	YNL205C	PCT1	P13259	424 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YNL205C	YNL205C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YNL205C	YNL205C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.5 ms