RNA–Protein interactions for RNA: YMR115W

MGR3, Transcript of Subunit of the mitochondrial (mt) i-AAA protease supercomplex, yeast

Gene MGR3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MGR3	YMR115W	UBX3	Q12229	455 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MGR3	YMR115W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	IML2	P47031	731 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YML131W	Q03102	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	BLS1	Q06071	122 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	THI3	Q07471	609 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YPT11	P48559	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YPR003C	P53394	754 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	BOP3	P53958	396 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	GTR1	Q00582	310 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	COX1	P00401	534 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	LAC1	P28496	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	MSS51	P32335	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YIL152W	P40455	235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	CDC1	P40986	491 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YNL144C	P53907	740 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	GCS1	P35197	352 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	HES1	P35843	434 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	SPC72	P39723	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YGR079W	P53249	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	PDR8	Q06149	701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	SSM4	P40318	1319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	SIR1	P21691	654 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	ERP2	P39704	215 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	CAB2	P40506	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	CIA1	Q05583	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	SSP2	Q08646	371 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	DSE3	Q08729	430 aa		4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YCR043C	P25361	127 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	PSY4	P38193	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	UBX6	P47049	396 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	POL3	P15436	1097 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	OCT1	P35999	772 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	SMK1	P41808	388 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	COG4	Q06096	861 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	MLH2	Q07980	695 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	GSH2	Q08220	491 aa		4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
MGR3	YMR115W	URK1	P27515	501 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RGT1	P32862	1170 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	VPS41	P38959	992 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	GTB1	Q04924	702 aa		4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YAT2	P40017	923 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	PUG1	P40100	303 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MAF1	P41910	395 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	SUL2	Q12325	893 aa		4.7	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	NUC1	P08466	329 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RIT1	P23796	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	CLB4	P24871	460 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MCM10	P32354	571 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RPN12	P32496	274 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	PSF2	P40359	213 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	TAM41	P53230	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	ATG21	Q02887	496 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	PIG1	Q06216	648 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MCH4	Q08268	501 aa		4.69	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YCL049C	P25577	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	BUD16	P39988	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MSY1	P48527	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	NDD1	Q08887	554 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	CHS3	P29465	1165 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MET30	P39014	640 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	PET122	P10355	254 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	RER1	P25560	188 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	XRS2	P33301	854 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	SLC1	P33333	303 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	MRPL36	P36531	177 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	VPS25	P47142	202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MGR3	YMR115W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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