RNA–Protein interactions for RNA: YIL039W

TED1, Transcript of Conserved phosphoesterase domain-containing protein, yeast

Gene TED1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TED1	YIL039W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	DBF20	P32328	564 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	AAT1	Q01802	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	SPT7	P35177	1332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	BI2	P03873	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	URK1	P27515	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	XBP1	P40489	647 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	ZAP1	P47043	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	ORM2	Q06144	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TED1	YIL039W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	COX1	P00401	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BIK1	P11709	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YCL049C	P25577	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BEM3	P32873	1128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IES5	P40060	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RAD26	P40352	1085 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	CIR1	P42940	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	TPO3	Q06451	622 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IRC3	Q06683	689 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	FTH1	P38310	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	UBP7	P40453	1071 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BLS1	Q06071	122 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MAK32	P23060	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	PSF2	P40359	213 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	SKP2	P42843	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YAT1	P80235	687 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	ATG16	Q03818	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	GSH1	P32477	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	FUI1	P38196	639 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	IFA38	P38286	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	ERV46	P39727	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BUD16	P39988	312 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	NMD5	P46970	1048 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RSC9	Q03124	581 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	GTB1	Q04924	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	PCD1	Q12524	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	NUC1	P08466	329 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	LAC1	P28496	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	SWC3	P31376	625 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	SAP185	P40856	1058 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	CIN1	P40987	1014 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	VMR1	P38735	1592 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	PTH2	P34222	208 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	HES1	P35843	434 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	UBX6	P47049	396 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	COX17	Q12287	69 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MET5	P47169	1442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MTF2	P10849	440 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	PTC6	P25646	442 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	LTP1	P40347	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	SNO3	P43544	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	GTR1	Q00582	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	TFC6	Q06339	672 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TED1	YIL039W	LTE1	P07866	1435 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	EXO84	P38261	753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	SMK1	P41808	388 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TED1	YIL039W	PTP1	P25044	335 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms