RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	OSW1	Q08692	278 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		15.28	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	MPH2	P0CD99	609 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	NPP1	P25353	742 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	RAD16	P31244	790 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	TFC3	P34111	1160 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	YKL097C	P34245	136 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	ADD66	P36040	267 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	MRP21	P38175	177 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	HXT5	P38695	592 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	YHR182W	P38870	785 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	TEL2	P53038	688 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	YDR109C	Q04585	715 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	LDB18	Q07887	179 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	PEX15	Q08215	383 aa		15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
RTC3	YHR087W	FMP27	Q06179	2628 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	15.26	■□□□□ 0.03	not detected
RTC3	YHR087W	KAR9	P32526	644 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	BST1	P43571	1029 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ILM1	P47155	203 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PEX8	P53248	589 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TFB2	Q02939	513 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	SYT1	Q06836	1226 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	GNT1	Q12096	491 aa		15.26	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PEX1	P24004	1043 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ARP1	P38696	384 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	YDR089W	P38966	869 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	CHS6	P40955	746 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	UFE1	P41834	346 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ARH1	P48360	493 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TRS31	Q03337	283 aa		15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	VAN1	P23642	535 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ATG12	P38316	186 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	YJR061W	P40355	935 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	HOS4	P40480	1083 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	MIG2	P53035	382 aa		15.24	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	MLS1	P30952	554 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	MET22	P32179	357 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TGL4	P36165	910 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	FRT2	P39734	528 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	NUP100	Q02629	959 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	CAN1	P04817	590 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	OXP1	P28273	1286 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	TSC10	P38342	320 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	SFB3	P38810	929 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	EFM6	P53970	246 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	CLN1	P20437	546 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	MRM1	P25270	412 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	APM3	P38153	483 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	USE1	P53146	245 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	DOS2	P54858	310 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	PET117	Q02771	107 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	YMR155W	Q03795	547 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	BSP1	Q06604	576 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RTC3	YHR087W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	RHO2	P06781	192 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	SNT1	P25357	1226 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	ISF1	P32488	338 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	SGE1	P33335	543 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	TOM20	P35180	183 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	RRN3	P36070	627 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	BZZ1	P38822	633 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	HAT2	P39984	401 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	AXL1	P40851	1208 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	YIG1	Q08956	461 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	YPQ1	Q12010	308 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RTC3	YHR087W	YSP3	P25036	478 aa		15.19	■□□□□ 0.02

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