RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-B

YHL009W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YHL009W-B, Length 5,409 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-BYHL009W-B DAM1P53267 343 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CRH1P53301 507 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TDA7P53882 636 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TGL2P54857 326 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPN4Q03465 531 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GAS4Q08271 471 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TMA16Q08687 178 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YPL272CQ08984 517 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AIM41Q12032 185 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YPS3Q12303 508 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B EAF3Q12432 401 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PRM7Q12459 698 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RAX2Q12465 1220 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MET5P47169 1442 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPS31P05759 152 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FUS1P11710 512 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GUK1P15454 187 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MAK32P23060 363 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MCM3P24279 971 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SEC21P32074 935 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PRS1P32895 427 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DEF1P35732 738 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MCD4P36051 919 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SPP381P38282 291 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B LEM3P42838 414 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MAD3P47074 515 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJR142WP47173 342 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B UBP8P50102 471 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MSN5P52918 1224 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CBK1P53894 756 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DIA1P54005 336 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YPL014WQ02606 381 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TAF8Q03750 510 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B UTP13Q05946 817 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PDR8Q06149 701 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SOR2Q07786 357 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MET17P06106 444 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B KCC4P25389 1037 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B CMK1P27466 446 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YKL151CP36059 337 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HSL7P38274 827 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RTS1P38903 757 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HXT13P39924 564 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SPR3P41901 512 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJR039WP47107 1121 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HNT2P49775 206 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B EXG2P52911 562 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MAL11P53048 616 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HXT17P53631 564 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NGL1Q08213 363 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FRE3Q08905 711 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SWI1P09547 1314 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MSB2P32334 1306 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GAL7P08431 366 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B GAL11P19659 1081 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ACE2P21192 770 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B URK1P27515 501 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ATG19P35193 415 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HES1P35843 434 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B BET3P36149 193 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B APL3P38065 1025 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NRG2P38082 220 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FAT1P38225 669 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IMD2P38697 523 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B ERC1P38767 581 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B KEL1P38853 1164 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YER186CP40101 306 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B VPS27P40343 622 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B BAP3P41815 604 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B OYE3P41816 400 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B IMD3P50095 523 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SAM37P50110 327 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MNT2P53059 558 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B OCA2P53949 197 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SRP1Q02821 542 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B AIM32Q04689 311 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YEL076C-AP0CX16 216 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YLR464WP0CX17 216 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B HEM13P11353 328 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B DAL81P21657 970 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B VPS34P22543 875 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B PRE8P23639 250 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B SAT4P25333 603 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B STP22P25604 385 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B TPD3P31383 635 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B MRP4P32902 394 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B NAT2P37293 288 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B APN2P38207 520 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FMO1P38866 432 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B FAD1P38913 306 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B OXA1P39952 402 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YEL076CP39971 216 aa-0.55□□□□□ -2.5
YHL009W-BYHL009W-B YJL213WP40896 331 aa-0.55□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 70.1 ms