RNA–Protein interactions for RNA: YBR215W

HPC2, Transcript of Subunit of the HIR complex, yeast

Gene HPC2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPC2	YBR215W	ASG1	P40467	964 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	BIO3	P50277	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YGL138C	P53122	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	IPI3	P53877	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PET117	Q02771	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	HDA3	Q06623	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	OMS1	Q06668	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YEH2	Q07950	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CTI6	Q08923	506 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	STE12	P13574	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YCR051W	P25631	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	CTF13	P35203	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PET10	P36139	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MRPL10	P36520	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	TAE1	P38340	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SMF1	P38925	575 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YIL092W	P40497	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RCM1	P53972	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	IRC4	Q03036	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	HDA2	Q06629	674 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YFT2	Q06676	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	HFI1	Q12060	488 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PUS9	Q12069	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GET4	Q12125	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
HPC2	YBR215W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PHO3	P24031	467 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	BMT2	P38278	337 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MED8	P38304	223 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YEL057C	P39983	233 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PIG2	P40187	538 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	PSF2	P40359	213 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ICE2	P40499	491 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	FET4	P40988	552 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RRN7	P40992	514 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	STB2	P46679	850 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GLG2	P47011	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	INP52	P50942	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	MPS2	P53159	387 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	DFG5	Q05031	458 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GSH2	Q08220	491 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	BMT6	Q12291	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.9	□□□□□ -1.62
HPC2	YBR215W	RAD3	P06839	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	INO1	P11986	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	CBS1	P14066	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MRPL33	P20084	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GIT1	P25346	518 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ZIP1	P31111	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SIN4	P32259	974 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SSO1	P32867	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
HPC2	YBR215W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YKL070W	P36087	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	UME6	P39001	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	BNA2	P47125	453 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	EFM3	P47163	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	COG2	P53271	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ARO10	Q06408	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	MSH5	Q12175	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	TIP41	Q12199	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GAL4	P04386	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HPC2	YBR215W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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