RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG8	YBL078C	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PET122	P10355	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CBS1	P14066	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	STE11	P23561	717 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ERG8	P24521	451 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	OCA4	P25366	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	EMC1	P25574	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ADK2	P26364	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MDL1	P33310	695 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	LST4	P34239	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	GCS1	P35197	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
ATG8	YBL078C	FTR1	P40088	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MND2	P40577	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	GCV2	P49095	1034 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SPO1	P53541	631 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RCO1	Q04779	684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	TMA10	Q06177	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MCM21	Q06675	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	HMI1	Q12039	706 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RCN2	Q12044	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	UPC2	Q12151	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YLR415C	O13578	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	KAR3	P17119	729 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	STE50	P25344	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SED4	P25365	1065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	STE14	P32584	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	STB6	P36085	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ALY1	P36117	915 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	FLC2	P39719	783 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YEL057C	P39983	233 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CIK1	Q01649	594 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YML119W	Q03208	357 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PKH1	Q03407	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	GYL1	Q04322	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	AIM6	Q07716	390 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	TMA16	Q08687	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	NMD4	Q12129	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	NFI1	Q12216	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	HSP42	Q12329	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	GRX6	Q12438	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CTT1	P06115	562 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	APE1	P14904	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PRE8	P23639	250 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	APT2	P36973	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	SIC1	P38634	284 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	JHD1	P40034	492 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MAM1	P40065	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	LCL3	P53153	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PEX25	Q02969	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	TPO1	Q07824	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATG8	YBL078C	STF1	P01098	86 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	KIN82	P25341	720 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	POL4	P25615	582 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	ATG19	P35193	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	UBP13	P38187	747 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	YBR259W	P38338	688 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	RTS1	P38903	757 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	GET2	P40056	285 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	DJP1	P40564	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	VPS4	P52917	437 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG8	YBL078C	OAZ1	Q02803	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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