RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	RAD24	P32641	659 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	HES1	P35843	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	UBX6	P47049	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YNL181W	P53878	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	AIM6	Q07716	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	CBP1	P07252	654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	CRD1	Q07560	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	GPA1	P08539	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	TGL1	P34163	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	YLF2	P38746	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	ATG27	P46989	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Q0144	Q0144	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	PHO3	P24031	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	YGR079W	P53249	370 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	YDR109C	Q04585	715 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	SLX4	Q12098	748 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	KAR1	P11927	433 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	MGR1	P25573	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	CPR3	P25719	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	CYB2	P00175	591 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	EXO84	P38261	753 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	LEU5	P38702	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	AAD4	Q07747	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	BAR1	P12630	587 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	SAN1	P22470	610 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	SDS22	P36047	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	PHM8	P40025	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	YNL234W	P53857	426 aa		4.78	□□□□□ -1.64
Q0144	Q0144	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	TRS65	P32893	560 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YLR455W	Q06188	304 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	NUR1	Q12066	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	DAP1	Q12091	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YLR049C	Q12110	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	REV1	P12689	985 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	RIM2	P38127	377 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	KRE9	P39005	276 aa		4.76	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YPK3	P38070	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YBR071W	P38243	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	SAW1	P39735	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	IMA5	P40884	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	SMA1	Q02651	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	GTB1	Q04924	702 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	MCP2	Q06567	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	ADH4	P10127	382 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	MSH1	P25846	959 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	RSF1	Q05043	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YJR061W	P40355	935 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	AZF1	P41696	914 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	MSY1	P48527	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	PHM6	Q05637	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	TLG2	Q08144	397 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	BSC1	Q12140	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	PDR3	P33200	976 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	SWD1	P39706	426 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	PPT2	Q12036	173 aa		4.72	□□□□□ -1.65
Q0144	Q0144	YHR218W	P38899	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	BAG7	Q12128	409 aa		4.71	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	FAA2	P39518	744 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	YIR014W	P40570	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	IAH1	P41734	238 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	ASI1	P54074	624 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	ICL2	Q12031	575 aa		4.7	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	PCT1	P13259	424 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	BUD14	P27637	709 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	SHE10	P53075	577 aa		4.69	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	CBS2	P14905	389 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	URK1	P27515	501 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	DJP1	P40564	432 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	ARP10	Q04549	284 aa		4.68	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	STE50	P25344	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	AVT5	P38176	459 aa		4.67	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	UBP12	P39538	1254 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	EKI1	Q03764	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	PSR2	Q07949	397 aa		4.66	□□□□□ -1.66
Q0144	Q0144	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	RTS2	P40962	232 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	SGF73	P53165	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	COG6	P53959	839 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0144	Q0144	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 41.7 ms