RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FGRP09769 529 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRT2P35908 639 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AFMP43652 599 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFIXQ14938 502 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.51□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAP7D2Q96T17 732 aa13.51□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DIXDC1Q155Q3 683 aa13.5□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC112Q8NEF3 446 aa13.5□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DYNLL2Q96FJ2 89 aa13.5□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPY2A6NKD2 308 aa13.5□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INTS13Q9NVM9 706 aa13.5□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMA3EO15041 775 aa13.49□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP2R5BQ15173 497 aa13.49□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.49□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.49□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.49□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.48□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC150Q8NCX0 1101 aa13.48□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa13.48□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COBLO75128 1261 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MORC3Q14149 939 aa13.47□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF25Q93038 417 aa13.47□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IL17RBQ9NRM6 502 aa13.47□□□□□ -0.25
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP17L4A6NCW7 530 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DDAH1O94760 285 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDC25AP30304 524 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STX17P56962 302 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRP5P59047 1200 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP17L1Q7RTZ2 530 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCN7AQ01118 1682 aa13.47□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALM1P0DP23 149 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALM2P0DP24 149 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALM3P0DP25 149 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCM7P33993 719 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP5P45974 858 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC38Q5R3I4 469 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VSTM4Q8IW00 320 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASGRP4Q8TDF6 673 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP21Q9UK80 565 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCG2P13521 617 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANKRD7Q92527 254 aa13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.46□□□□□ -0.26
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LDHBP07195 334 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
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