RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 PEX10O60683 326 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 USP17L24Q0WX57 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ACER1Q8TDN7 264 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 C12orf42Q96LP6 360 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 RBPJLQ9UBG7 517 aa26.19■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 PRKAB2O43741 272 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SGPL1O95470 568 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CYP2D6P10635 497 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SEPT2Q15019 361 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 UBE3CQ15386 1083 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 DCTPP1Q9H773 170 aa26.18■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 HMGCRP04035 888 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 MAPK4P31152 587 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ERVK-9P63128 1117 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 ERVK-24P63145 666 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 EVX2Q03828 476 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 DPF3Q92784 378 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 DEFB118Q96PH6 123 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SWAP70Q9UH65 585 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 GJD2Q9UKL4 321 aa26.17■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 VCAM1P19320 739 aa26.16■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CYP2B6P20813 491 aa26.16■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 Q3C1V9 767 aa26.16■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.16■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.16■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CHGBP05060 677 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 GUCY1A2P33402 732 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.15■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 CCNA1P78396 465 aa26.14■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.14■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CIPC-208ENST00000557115 WDR78Q5VTH9 848 aa26.13■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 PORCNQ9H237 461 aa26.13■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 USP17L12C9JPN9 530 aa26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 USP17L21D6R901 530 aa26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CAPN2P17655 700 aa26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 GPR142Q7Z601 462 aa26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 PLEKHH3Q7Z736 793 aa26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.11■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 C12orf60Q5U649 245 aa26.11■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.11■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 RPTORQ8N122 1335 aa26.11■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 DOCK3Q8IZD9 2030 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 A0A1W2PRG0 241 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 TRIB2Q92519 343 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CCDC17Q96LX7 622 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa26.1■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 H0YGN5 161 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 AKR1B1P15121 316 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 RGS2P41220 211 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CDK8P49336 464 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 ICA1Q05084 483 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 TRIM32Q13049 653 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 TANGO6Q9C0B7 1094 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.09■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CNMDO75829 334 aa26.08■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 CTR9Q6PD62 1173 aa26.08■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 SH2D4AQ9H788 454 aa26.08■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa26.08■■□□□ 1.77
CIPC-208ENST00000557115 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 COG2Q14746 738 aa26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 LBX2Q6XYB7 198 aa26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 HOXC10Q9NYD6 342 aa26.07■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 ATP2B2Q01814 1243 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 MORN1Q5T089 497 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 APPBP2Q92624 585 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 APBA2Q99767 749 aa26.06■■□□□ 1.76
CIPC-208ENST00000557115 BTBD7Q9P203 1132 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms