RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.17■■□□□ 1.78
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PTPRK-222ENST00000532751 VPS53Q5VIR6 699 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRK-222ENST00000532751 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
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PTPRK-222ENST00000532751 C12orf42Q96LP6 360 aa26.12■■□□□ 1.77
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PTPRK-222ENST00000532751 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRK-222ENST00000532751 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRK-222ENST00000532751 PRDM1O75626 825 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRK-222ENST00000532751 TRIM17Q9Y577 477 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PRG0 241 aa26.07■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 BCRP11274 1271 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 CHMLP26374 656 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 USP17L18D6R9N7 530 aa26.06■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L19D6RCP7 530 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 USP17L20D6RJB6 530 aa26.06■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 LAMA4Q16363 1823 aa26.05■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.05■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.04■■□□□ 1.76
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PTPRK-222ENST00000532751 VCPKMTQ9H867 229 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 TOMM22Q9NS69 142 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 NYAP2Q9P242 653 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 TSPY2A6NKD2 308 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF213O14771 459 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 GNRH1P01148 92 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 HAND2P61296 217 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 BMP2KLQ5H9B9 411 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 SKAP1Q86WV1 359 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRK-222ENST00000532751 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
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