RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 JMYQ8N9B5 988 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FAM200AQ8TCP9 573 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CRAMP1Q96RY5 1269 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CLRN2A0PK11 232 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PPIP5K2O43314 1243 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SLC16A2P36021 539 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SLC39A14Q15043 492 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC96Q2M329 555 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KLHL10Q6JEL2 608 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZFPM1Q8IX07 1006 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DHX58Q96C10 678 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CEP95Q96GE4 821 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KLRF2D3W0D1 207 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ADAMTS3O15072 1205 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 COBLO75128 1261 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KIF5BP33176 963 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SLC15A2Q16348 729 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SLF2Q8IX21 1173 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FLT1P17948 1338 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PLSCR1O15162 318 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KRT2P35908 639 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZSCAN30Q86W11 494 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 NRBP1Q9UHY1 535 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SMC2O95347 1197 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 LONRF3Q496Y0 759 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TEKT1Q969V4 418 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 VEZTQ9HBM0 779 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 WDR19Q8NEZ3 1342 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SHC4Q6S5L8 630 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 AKT1S1Q96B36 256 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 EPSTI1Q96J88 318 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 COA1Q9GZY4 146 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 MYH13Q9UKX3 1938 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TRIM75PA6NK02 468 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 WNT7AO00755 349 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FBXL16Q8N461 479 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PPP1R9BQ96SB3 815 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ANAPC4Q9UJX5 808 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TCP10L2B9ZVM9 353 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 YEATS4O95619 227 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 RASA1P20936 1047 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SNAP25P60880 206 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 RCSD1Q6JBY9 416 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF287Q9HBT7 754 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 GDF11O95390 407 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SCG2P13521 617 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 NAPAP54920 295 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PKN1Q16512 942 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 TMTC3Q6ZXV5 915 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 USP17L5A8MUK1 530 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ECE2O60344 883 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CALM1P0DP23 149 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CALM2P0DP24 149 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CALM3P0DP25 149 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 AKR1B1P15121 316 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 KCTD1Q719H9 257 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC186Q7Z3E2 898 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 LARGE2Q8N3Y3 721 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CSRNP2Q9H175 543 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 C4BP0C0L5 1744 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 LAMA4Q16363 1823 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PLCG2P16885 1265 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 COA7Q96BR5 231 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 ANO10Q9NW15 660 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 SERTAD1Q9UHV2 236 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 MARCH6O60337 910 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRK-216ENST00000524481 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms