RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 DPH6Q7L8W6 267 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-204ENST00000489160 TTC6Q86TZ1 520 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-204ENST00000489160 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-204ENST00000489160 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-204ENST00000489160 SLC9A7Q96T83 725 aa7.59□□□□□ -1.19
CCL20-204ENST00000489160 HMX2A2RU54 273 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 RGS13O14921 159 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 IGLV1-40P01703 118 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 ACRP10323 421 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 LGR6Q9HBX8 967 aa7.58□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 NFIAQ12857 509 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 FXNQ16595 210 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.57□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 KIF2CQ99661 725 aa7.57□□□□□ -1.2
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CCL20-204ENST00000489160 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.56□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.56□□□□□ -1.2
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CCL20-204ENST00000489160 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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CCL20-204ENST00000489160 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 MKL1Q969V6 931 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 MIPEPQ99797 713 aa7.55□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 ITGB7P26010 798 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CHMP4BP1P59074 171 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CDK5R2Q13319 367 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 NFE2L2Q16236 605 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 DDR2Q16832 855 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.54□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 CLEC3AO75596 197 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 SLITRK5O94991 958 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 ETV3P41162 512 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 BBS9Q3SYG4 887 aa7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCL20-204ENST00000489160 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.53□□□□□ -1.2
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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CCL20-204ENST00000489160 ZAR1Q86SH2 424 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 TMEM192Q8IY95 271 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 ST7Q9NRC1 585 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.52□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 DDAH1O94760 285 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 SLC7A5Q01650 507 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 RIN3Q8TB24 985 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 ATG3Q9NT62 314 aa7.51□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 WDR64B1ANS9 1081 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 GJB6O95452 261 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 EOMESO95936 686 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 FAM87AP0C7U9 286 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 CYP7A1P22680 504 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 RNF4P78317 190 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 CYP27A1Q02318 531 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 GNPTABQ3T906 1256 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 CDH24Q86UP0 819 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 FBXL6Q8N531 539 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 GATA6Q92908 595 aa7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CCL20-204ENST00000489160 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa7.5□□□□□ -1.21
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