RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 GNAQP50148 359 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 PRELPP51888 382 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TCP10Q12799 353 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TROAPQ12815 778 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 RCSD1Q6JBY9 416 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 NUP133Q8WUM0 1156 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 IL17RBQ9NRM6 502 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 WNT10BO00744 389 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CDC27P30260 824 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 SHMT1P34896 483 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CACNB3P54284 484 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 NTRK3Q16288 839 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 MICALL2Q8IY33 904 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 PNMA1Q8ND90 353 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 DDX11Q96FC9 970 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 GJA3Q9Y6H8 435 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 H7C1D1 291 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CSRNP1Q96S65 589 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 MYL10Q9BUA6 226 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 STX8Q9UNK0 236 aa14.98□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CLRN2A0PK11 232 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TBC1D12O60347 775 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 NMT2O60551 498 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 DEXIO95424 95 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TTLL1O95922 423 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 RXRAP19793 462 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TRIM29Q14134 588 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 GRM4Q14833 912 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 HOOK2Q96ED9 719 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CEP95Q96GE4 821 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 C8orf76Q96K31 380 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 VEZTQ9HBM0 779 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CNTNAP1P78357 1384 aa14.97□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 MYH6P13533 1939 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 AKR1B1P15121 316 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 XBP1P17861 261 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 DNAJC18Q9H819 358 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.96□□□□□ -0.01
NISCH-203ENST00000460759 SMARCA1P28370 1054 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 ATL3Q6DD88 541 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 NBPF11Q86T75 865 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 ALG1Q9BT22 464 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 SLC26A6Q9BXS9 759 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 CABP5Q9NP86 173 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 RNF181Q9P0P0 153 aa14.95□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 MYH4Q9Y623 1939 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 NBR1Q14596 966 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 BRAPQ7Z569 592 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 PHKBQ93100 1093 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 GINM1Q9NU53 330 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 NYAP2Q9P242 653 aa14.94□□□□□ -0.02
NISCH-203ENST00000460759 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms