RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SIRT1Q96EB6 747 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PFDN4Q9NQP4 134 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 V9GY48 417 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3BP5O60239 455 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMD6Q15008 389 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ASIC2Q16515 512 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.453e-9■■□□□ 13.8
EFTUD2-202ENST00000426333 TAOK1Q7L7X3 1001 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 EYA2O00167 538 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SMTNP53814 917 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC8A3P57103 927 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RABEP2Q9H5N1 569 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC38Q502W7 563 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 BEND3Q5T5X7 828 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 APPBP2Q92624 585 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NUF2Q9BZD4 464 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD2Q9GZV1 360 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa12.23□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GIPC1O14908 333 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC27A2O14975 620 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 LIN9Q5TKA1 542 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC62Q6P9F0 684 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FCHSD1Q86WN1 690 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FLT4P35916 1363 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CLGNO14967 610 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SGSM2O43147 1006 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 FLOT1O75955 427 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF131P52739 623 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF12Q16514 161 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT71Q3SY84 523 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 HHATQ5VTY9 493 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PHACTR3Q96KR7 559 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TXKP42681 527 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC38Q5R3I4 469 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB7Q99436 277 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GLT8D2Q9H1C3 349 aa12.22□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ITSN1Q15811 1721 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL7Q8IXQ5 586 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX11Q8IYF3 940 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DBNDD2Q9BQY9 259 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TAB2Q9NYJ8 693 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC169A6NNP5 214 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS6KA1Q15418 735 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DDB1Q16531 1140 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT14Q6ZU15 432 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX14Q9Y5W7 946 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP12P59046 1061 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL30Q0D2K2 578 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 LGSNQ5TDP6 509 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SLF1Q9BQI6 1058 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 SH2D4AQ9H788 454 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 LRWD1Q9UFC0 647 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 TSKSQ9UJT2 592 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND2AQ9ULE3 1009 aa12.21□□□□□ -0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT15P19012 456 aa12.21□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EPSTI1Q96J88 318 aa12.21□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF5Q96JK2 942 aa12.21□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PTCH1Q13635 1447 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CRCPO75575 148 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ITIH3Q06033 890 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 HAUS7Q99871 368 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF35A5YM69 484 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP1P32455 592 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R5BQ15173 497 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GPAA1O43292 621 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPFIA4O75335 1185 aa12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 OAS2P29728 719 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR3Q13615 1198 aa12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms