RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GPR162Q16538 588 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PIM2Q9P1W9 311 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KIF16BQ96L93 1317 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TBX4P57082 545 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IL16Q14005 1332 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KLHL33A6NCF5 533 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CTAGE5O15320 804 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 VDRP11473 427 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TLL1O43897 1013 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DDR1Q08345 913 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SERINC3Q13530 473 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LONRF1Q17RB8 773 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 WDR90Q96KV7 1748 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CHL1O00533 1208 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NFIXQ14938 502 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NYXQ9GZU5 481 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HSD3B2P26439 372 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PEX19P40855 299 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TMPOP42166 694 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GJA8P48165 433 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EPHA4P54764 986 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC39A6Q13433 755 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AGERQ15109 404 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 JDP2Q8WYK2 163 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 STIM2Q9P246 746 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SUN2Q9UH99 717 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SERPINB2P05120 415 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CASQ1P31415 396 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ATP2B2Q01814 1243 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PARP10Q53GL7 1025 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CNKSR1Q969H4 720 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KLRG1Q96E93 195 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LAMB2P55268 1798 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 UTRNP46939 3433 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa7.24□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 Q3C1V9 767 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MSL1Q68DK7 614 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SMIM5Q71RC9 77 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IER2Q9BTL4 223 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FANCLQ9NW38 375 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TIMM44O43615 452 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GABBR2O75899 941 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM163BP0C2L3 166 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TAF4BQ92750 862 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ARMC5Q96C12 935 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EFCC1Q9HA90 598 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RRM1P23921 792 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ST5P78524 1137 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TKFCQ3LXA3 575 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SLC39A7Q92504 469 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EDEM1Q92611 657 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.23□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SNTG2Q9NY99 539 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms